La Sociedad Española de Oncología Médica elabora periódicamente Guías Clínicas especializadas por patologías con estándares organizativos y criterios de calidad que facilitan la práctica clínica.
Bajo la supervisión de la Junta Directiva de la SEOM se redactan las guías clínicas basadas en la evidencia científica. Desde el 2014 las guías clínicas se hacen en colaboración con los Grupos Cooperativos de Investigación y se publican en open access en la revista científica Clinical &Translational Oncology (CTO), lo que facilita el acceso a las mismas, su utilización y la posibilidad de referenciarlas en otros artículos.